Храм святых Двенадцати Апостолов в Балаклаве имеет древнюю историю, уходящую в глубины веков через генуэзский период к византийскому. Это старейшая действующая в Крыму православная церковь. Архитектура храма признана уникальной и является памятником XVIII века.

Буквально в двух шагах от Балаклавской набережной, на соседней с ней улице имени А.И. Калича находится старейшая в Крыму действующая церковь – Храм святых Двенадцати Апостолов. Уникальное своей историей и архитектурой культовое сооружение неприметно расположилось вблизи от шумного туристического центра, тем не менее, оставаясь незаметным от бухты и пребывая погруженным в собственную трансцендентную тишину. Если свернуть сразу за кинотеатром «Родина», подняться по переулку выше мимо дома №25, попадаешь к живописной лестнице, справа от неё уже можно заметить сияющий золотом купол церкви Двенадцати Апостолов. Гостей храм встречает торжественной колоннадой, в тени которой, над входом, горит светлячок священного огня.

Возведена церковь была в 1357 году, когда на месте нынешней Балаклавы полноправными хозяевами были генуэзцы. Проводить такую датировку позволяет табличка, найденная в 1861 году при реконструкции здания в стене, под слоем штукатурки: «1357, в день сентября, начата эта постройка во время управления скромного мужа Симоно дель Орте, консула и кастеляна». «Скромный муж» предположительно был одним из первых консулов Чембало – крепости, чьи развалины и поныне возвышаются на ближайшей горе. Так что первоначальное название церкви святых Двенадцати Апостолов – храм Симона дель Орте. Примечательно, что находка была сделана уже после Крымской войны и оккупации Балаклавы союзниками в 1854-56 годах, когда Альфонс де Ла-Мармора – итальянский командующий вывозил отсюда все таблички и надписи, принадлежавшие генуэзцам. Также есть версия, что Симоно дель Орте строил святыню на фундаменте византийского храма VI века. В таком случае церковь претендует на звание старейшего православного храма не только на территории полуострова, но и всего СНГ.

Согласно справочной книге Таврической епархии и епископу Симферопольскому и Таврическому Гермогену, церковь была построена и освящена во имя Двенадцати Апостолов ещё в 1375 году. Тот же автор пишет, что каменное здание храма на этом месте воздвигли в 1794 году, но церковь была сильно повреждена неприятелем в Крымскую войну и восстановлена силами прихожан только к 1875-му, в сей год, 8 июля, её освятили во имя святого Николая Чудотворца. До войны храм был в ведении главного священника армии и флота, здесь хранили знамёна и реликвии Балаклавского греческого батальона. После его расформирования церковь перешла в епархиальное ведомство.

С приходом советской власти храм Двенадцати Апостолов постигла участь большинства культовых сооружений – его закрыли. Службы проводились в церкви только в период Великой Отечественной войны, после которой православная святыня снова использовалась не по назначению: здесь был Дом Пионеров и клуб Осоавиохим.

В 1990-е годы храм передали Православной церкви. Восстановительные работы в полуразрушенном здании начал архимандрит Августин, в то время бывший протоиереем Александром. Проект реставрации разработал столичный архитектор Ю.Г. Лосицкий. Церемония торжественного освящения храма святых Двенадцати Апостолов состоялась 13 июля 1990 года.

В своём современном виде церковь является уникальным образцом архитектуры XVIII века: подобного рода постройки в Крыму больше нигде не встречаются. Это четырёхстолпная крестово-купольная постройка, выполненная из бутового известняка. Главный вход в храм сделан в форме портика из белого инкерманского камня с треугольным фронтоном и четырьмя колоннами дорического ордера. Несмотря на свои небольшие размеры, храм внутри очень светлый и величественный, стены его белые, без фресок, а свод поддерживают дорические колонны.

В настоящее время церковь стала подворьем Инкерманского Свято-Климентовского монастыря. Здесь сохраняются частицы мощей святого блаженного Василия и святого преподобного Сергия Радонежского.